カバレッジレポートから、ファイルを除外するためには、asim コマンドに-cc_exclude スイッチを使用しまて行います。
For Example:
asim TB -lib <working_library> -acdb +access+r -cc_exclude <file_name> -cc_hierarchy acdb report -o only_dut.acdb -path /TB/DUT